Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Paf1Q8K2T8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Paf1Q8K2T8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Paf1Q8K2T8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms