Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc12Q8K2L8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trappc12Q8K2L8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc12Q8K2L8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms