Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1eQ8K202 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1eQ8K202 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms