Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LgsnQ8CIX8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LgsnQ8CIX8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms