Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syne4Q8CII8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syne4Q8CII8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms