Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nupl2Q8CIC2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms