Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbm28Q8CGC6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbm28Q8CGC6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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