Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc43a2Q8CGA3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc43a2Q8CGA3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms