Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hpf1Q8CFE2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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Hpf1Q8CFE2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hpf1Q8CFE2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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