Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klf17Q8CFA7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf17Q8CFA7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms