Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms