Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN6

Txnl1, Thioredoxin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnl1Q8CDN6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Txnl1Q8CDN6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Txnl1Q8CDN6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms