Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc87Q8CDL9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc87Q8CDL9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms