Protein–RNA interactions for Protein: Q8C992

A730015C16Rik, RIKEN cDNA A730015C16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A730015C16RikQ8C992 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A730015C16RikQ8C992 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A730015C16RikQ8C992 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms