Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppfibp1Q8C8U0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms