Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXG3

Ift57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift57Q8BXG3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift57Q8BXG3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift57Q8BXG3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms