Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Ctdsp2Q8BX07 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Ctdsp2Q8BX07 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Ctdsp2Q8BX07 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Ctdsp2Q8BX07 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctdsp2Q8BX07 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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