Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp38Q8BW70 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp38Q8BW70 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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