Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms