Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Snx17Q8BVL3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx17Q8BVL3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms