Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scfd2Q8BTY8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scfd2Q8BTY8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms