Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AtripQ8BMG1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AtripQ8BMG1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms