Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnrc6bQ8BKI2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms