Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prune1Q8BIW1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms