Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf41Q8BH75 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf41Q8BH75 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf41Q8BH75 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf41Q8BH75 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf41Q8BH75 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf41Q8BH75 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf41Q8BH75 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf41Q8BH75 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf41Q8BH75 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf41Q8BH75 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf41Q8BH75 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf41Q8BH75 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms