Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Bhlhe23Q8BGW3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe23Q8BGW3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms