Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg4dQ8BGV9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms