Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2af1l4Q8BGJ9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms