Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Katnb1Q8BG40 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Katnb1Q8BG40 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms