Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnpo1Q8BFY9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnpo1Q8BFY9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms