Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srgap3Q812A2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms