Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg4cQ811C2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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