Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc172Q810N9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc172Q810N9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms