Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZQ7

BC048562, cDNA sequence BC048562, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048562Q80ZQ7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048562Q80ZQ7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048562Q80ZQ7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048562Q80ZQ7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048562Q80ZQ7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048562Q80ZQ7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048562Q80ZQ7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048562Q80ZQ7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048562Q80ZQ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048562Q80ZQ7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048562Q80ZQ7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BC048562Q80ZQ7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BC048562Q80ZQ7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BC048562Q80ZQ7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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BC048562Q80ZQ7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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BC048562Q80ZQ7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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BC048562Q80ZQ7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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BC048562Q80ZQ7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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BC048562Q80ZQ7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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BC048562Q80ZQ7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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BC048562Q80ZQ7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC048562Q80ZQ7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BC048562Q80ZQ7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BC048562Q80ZQ7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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