Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbed4Q80WQ9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms