Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms