Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rexo1Q7TT28 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rexo1Q7TT28 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms