Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClmQ7TSN2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ClmQ7TSN2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms