Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccp110Q7TSH4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms