Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Actn1Q7TPR4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Actn1Q7TPR4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actn1Q7TPR4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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