Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ShprhQ7TPQ3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms