Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim17Q7TPM3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim17Q7TPM3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms