Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nphp3Q7TNH6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms