Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HhipQ7TN16 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HhipQ7TN16 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms