Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sys1Q78S06 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms