Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK2

Usmg5, Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usmg5Q78IK2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usmg5Q78IK2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms