Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sned1Q70E20 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sned1Q70E20 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sned1Q70E20 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms