Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpv1Q704Y3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpv1Q704Y3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms