Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SpopQ6ZWS8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SpopQ6ZWS8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SpopQ6ZWS8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms