Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms